纳豆，在人们越来越注意营养和健康的年代，将具有非常光明的发展前景。据有关统计表明，日本大约90%以上的人有食用纳豆的习惯，大约有400多家纳豆公司的各式各样的产品充斥市场。特别是有关纳豆菌能有效抑制O-157大肠杆菌等有关功能得到证实后，纳豆需求量不断上涨，1997年产值达到11亿美元，仅大豆原料就用了11万吨。上世纪90年代末，日本经济萧条，正当很多公司面临倒闭和破产时，纳豆行业却蒸蒸日上，生意兴隆，日本关西超市纳豆销量以每年20%～40%的速度增长。
今后20年我国将进入老龄化社会，目前60岁以上的老人已达到1亿以上，占人口比例的8.7%，而血栓性疾病又是中老年人的高发病，是死亡危协最大的疾病之一，现在使用的溶栓药物链激酶、尿激酶、组织型纤溶酶原激活剂等都存在几个明显的不足：产生再栓塞和出血性副作用，且价格昂贵。而纳豆中能分离出一种叫纳豆激酶的物质，是血栓良好的溶解剂。经有关专家研究发现，纳豆不仅是一种优质的健康食品，而且还可以广泛的用于其它领域。如日本现在以纳豆丝为原料，开发出一种吸水性极强的纳豆树脂，该树脂可成为沙漠及缺水地区理想的种子胞衣材料，因为它具有极强的吸水性，是纸和尿不湿的五倍。有人曾利用这种胞衣材料包裹种子，在缺水地区一周时间就发芽了。目前，人们正在进行深入研究，如果把这种材料在我国西部地区推广，不久沙漠可望实现绿化，21世纪人类面临的环境问题将可以得到很好地解决。还可以把纳豆运用于环保领域，据说日本用纳豆黏液制成了透明的纳豆饭盒，既能吃下去，也能扔到地里作肥料，有的教授还对纳豆黏液的强化作用进行了深入地研究，发现纳豆固化土地的效果非常好，可以用它来治理我国大部分地区的水土流失问题。我国很多地区都是优质大豆的生产基地，利用生物技术进行大豆的深加工，不仅能使农民的收入在原来的基础上增加4倍，而且还可以解决剩余劳动力的就业问题，可谓收到了经济效益又具有社会意义。但目前纳豆在我国还有待进一步发展，有关纳豆的研究机构和生产企业数量十分有限，希望有关部门尽快出台相关政策，对纳豆产业给予大力扶持，并对国内外纳豆的研究成果和成熟经验给予重视，鼓励企业和科研院所合作，共同开发出更多更好适合大众口味的纳豆食品。